内设 6 个机构：

（一）综合办公室。负责党的基层组织建设、党员教育管理、党员发展、党费管理、党内生活制度的贯彻执行；负责草拟、制定与完善党政工作规章制度；负责人才招聘、转正晋升、薪酬福利、考勤考核、培训进修、劳动关系、档案等人事管理工作；做好人才服务和保障工作；负责上级和院外来文的收发、办理、归档及管理工作；负责研究院公章、院领导印章的管理与使用；建立健全财务计划体系，合理组织编制年度财务收支计划及财务综合预算，有效控制预算执行，完整、准确编制决算，做好财务分析，如实反映研究院财务状况；负责财务管理与会计核算工作，对研究院经济活动的合法性、合理性进行监督，建立健全各类财会业务的内部控制体系和监督制度，维护财经纪律，防范财务风险；服务各业务部门，做好组织协调与后勤保障工作；负责科研项目收集、组织申报、实施及验收、科研统计工作等；配合科研团队组织科技成果评审、鉴定、登记，协助专利申请、软件登记以及各级各类科技奖励组织申报等工作；负责有关项目地方配套扶持的申请与跟进服务；负责研究院科研相关项目的跟进与协调；负责研究院学术交流活动的组织与管理；负责科技新闻撰写、研究院官网定期更新与维护等工作。负责对外交流计划的统筹管理和资源开拓，包括计划的制定、协议的拟订、交流项目的实施和运转情况的跟踪管理。完成研究院领导交办的其他工作。

（二）香料作物品种资源研究所。主要从事草果、山胡椒、花椒等种质资源收集、保存、评价与利用，优良品种选育研究、栽培与管理新技术研发与试验示范推广；在重要基因挖掘、功能验证与分子设计育种研究领域联合科研院所、高校、企业协同创新；香料作物种质资源圃、种质资源库管理与利用等。

（三）香料产品加工研究所。主要围绕香料原料初中级加工，香料食品、调味品等新产品开发，开展相关技术与加工工艺、质量标准研究；在产品精深加工领域联合科研院所、高校、企业协同创新等。

（四）香料检测中心。产品质量安全检测与监测，产品质量安全溯源技术研究，产品质量安全地方标准研究与制修订，产品有效成分、功能成分分析，标准认定与认证、品牌创建等。

（五）香料产业经济与发展研究中心。主要围绕产业结构调整与升级，产业布局、产业政策、产业发展战略与规划等问题进行研究；分析与预测香料产业发展格局与趋势，收集研判国内外香料产业市场信息，为政府和企业决策提供咨询；在“一带一路”建设背景下，研究香料产业“数字化”、“智能化”发展。

（六）香料科技培训和文化研究中心。统筹规划全院科技培训工作，编制年度培训计划、工作方案并组织实施；负责年度培训情况的统计和总结工作；承接州政府委托的培训任务；配合院内有关职能部门的工作，开展相关业务培训；征集各研究所的培训项目，组织、协调各研究所、中心开展各类科技培训活动；承担其他与科技培训相关的工作；收集研究国内外使用香料传统与香料贸易发展历史，梳理研究香与民俗、养生、宗教、礼仪、文化艺术等关系，发掘民族用香习惯与揭示蕴藏的科学道理，研究和讲好怒江州内各民族用香故事，促进绿色香料产业与旅游文化产业融合发展。